未來醫(yī)生的必修課:菌群生態(tài)(2)
2010-12-09 13:43
閱讀:2869
來源:中新網(wǎng)
作者:水**南
責任編輯:水北天南
[導讀] 菌群生態(tài)或稱為未來醫(yī)生的必修課,盡管生態(tài)微生物學提供了一個框架來理解人類微生物群落,但它的所有方法和原則,離臨床應用都還有一定距離
另一位合作者是戴維?瑞爾曼,在加利福尼亞斯坦福大學研究人體微生物群落。班菲爾德和研究小組開發(fā)了一種技術,能從大量微生物DNA序列碎片識別出它們的屬系和品種,用軟件來分析各菌種的身份特征、新陳代謝及功能,以揭示菌群的生化過程。對比之下,當前通行的16S核糖體RNA基因測序和一些自動化生物信息分析難于顯示相近微生物屬種間的不同,很難揭示一些細微的基因重排。
但這種方法只能用來分析簡單的群落,比如理查曼德礦帶,其最大數(shù)量的菌種占了整個群體的40%。而成人腸道含有數(shù)百種微生物,數(shù)量最大的菌種只占4%。“但我們的研究并非不可進行。”瑞爾曼說,他想同樣細致地分析人體微生物,早產(chǎn)嬰兒是實驗班菲爾德技術的最佳對象。每個早產(chǎn)新生兒體內(nèi)菌種只有12種左右,與酸礦廢水相當,加強護理病房制造了一個無菌的、高度控制的環(huán)境來研究它們。
3人在一年前開始了合作,把班菲爾德的技術用在了早產(chǎn)新生兒身上,他們集中于健康嬰兒。莫羅維茨每天采集新生兒糞便樣本,分離DNA送到高通量測序中心,將數(shù)據(jù)發(fā)給班菲爾德和瑞爾曼;瑞爾曼用16S測序做菌種和數(shù)量普查;班菲爾德選擇一些節(jié)點作更詳細測序,分析種類和基因情況。
他們研究了孕28周早產(chǎn)嬰兒在前三周里的生命情況,追蹤了微生物群在種類數(shù)量上詳細快速的變化,以查找是否存在某種特殊的細菌或菌群與NEC有關,并協(xié)助預測哪種嬰兒容易染病,進而找出預防辦法。進一步,他們希望繪制出新生兒腸道菌群的簡化模型,將這些生態(tài)原則擴展應用到人類的微生物系統(tǒng)中。
版權聲明:
本站所注明來源為"愛愛醫(yī)"的文章,版權歸作者與本站共同所有,非經(jīng)授權不得轉(zhuǎn)載。
本站所有轉(zhuǎn)載文章系出于傳遞更多信息之目的,且明確注明來源和作者,不希望被轉(zhuǎn)載的媒體或個人可與我們
聯(lián)系zlzs@120.net,我們將立即進行刪除處理