通常拍攝大腦等器官需要將它們切成薄剖面,這就會破壞掉細胞間的長距離連接。整體成像的方法能保持器官完整,但是通常與研究基因和其它事物的方法不匹配。這項新技術(shù)能讓科學家們以不同的尺度對完整的器官進行研究。
一項發(fā)表于《自然》雜志的研究表明,腦組織切片研究的時代可能即將終結(jié)。一種新的成像技術(shù)CLARITY技術(shù)能使大腦透明,并提供完整無損的神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)3D圖像,包括精細回路和分子連接。
這種方法是將細胞周圍的脂肪組織去除并且使它們變得透明,而且能保留組織結(jié)構(gòu)。首先把器官浸泡到一種化學混合物中,并且輕微加熱使其形成一種網(wǎng)格保留住除 脂肪之外的所有部分。這就會使器官保持完整而且?guī)缀跬该?,足以透過它進行閱讀。隨后就能夠加入分子標記,對透明器官的特定部位進行著色。德賽羅斯和他的團 隊使用這項技術(shù)來拍攝一只成年老鼠的大腦影像。這項技術(shù)使他們能夠深入的觀察到神經(jīng)連接和局部回路,以及細胞和分子水平的細節(jié)。
科學家說CLARITY已經(jīng)開啟了神經(jīng)影像學檢查的新時代,這將在之前美國總統(tǒng)奧巴馬宣布的大腦圖譜計劃中發(fā)揮重要作用。負責制定大腦圖譜計劃實施路線圖工作小組的主席斯坦福大學神經(jīng)生物學家William Newsome博士稱,CLARITY方法完全是令人震驚的。
CLARITY是指清晰脂質(zhì)交換丙烯酰胺雜交精細成像/免疫染色/原位雜交相容性組織水凝膠。該技術(shù)涉及化學工程與生物工程,由斯坦福大學Karl Deisseroth博士領(lǐng)導(dǎo)的團隊開發(fā)。Karl Deisseroth博士是一名生物工程學家和精神病學家,也是路線圖工作小組的成員。
研究介紹
研究人員通過CLARITY技術(shù),在保持大腦完整性的同時,抽出了大腦中的不透明物質(zhì)(脂類)。脂類在大腦中幫助形成細胞膜,并賦予大腦多種結(jié)構(gòu),不過也令化學物質(zhì)和光線難以深入大腦。
研究人員用一種水凝膠來替換大腦中的脂類,他們將死后的完整大腦浸入水凝膠溶液,讓溶液中的單體進入組織,然后對其稍微加熱。在差不多達到體溫時,上述單體開始凝聚為長分子鏈,在大腦中形成高分子網(wǎng)絡(luò)。這一網(wǎng)絡(luò)能夠支持大腦中的所有結(jié)構(gòu),但不會結(jié)合脂類。隨后,研究人員快速將脂類抽出,獲得了完整透明的3D大腦,大腦中的神經(jīng)元、軸突、樹突、突觸、蛋白、核酸等等都完好的維持在原位。
研究人員構(gòu)建了表達熒光蛋白的小鼠,并用CLARITY成像了它的整個大腦。他們用傳統(tǒng)顯微鏡展示了其中的發(fā)光信息,例如蛋白嵌入細胞膜和單個神經(jīng)纖維。又通過電鏡揭示了其中的精細結(jié)構(gòu),例如突觸。
研究還顯示,在CLARITY處理的小鼠大腦中,熒光抗體能夠使其特異性結(jié)合的目標發(fā)光。在這一系統(tǒng)中,人們可以追溯神經(jīng)環(huán)路,解析局部環(huán)路的細微差異,觀察細胞間的聯(lián)系和分析亞細胞結(jié)構(gòu)。此外,人們還可以利用這一技術(shù),探尋蛋白復(fù)合體、核酸和神經(jīng)遞質(zhì)之間的化學關(guān)聯(lián)。
這項技術(shù)的另一個重要亮點在于,人們可以去除已染色的熒光抗體,并用其他抗體進行重新染色,以便在同一個大腦中研究不同的分子目標。研究顯示,這種染色/褪色過程可以重復(fù)多次。
Deisseroth博士稱,"CLARITY技術(shù)使生物組織轉(zhuǎn)化成可在完好無損狀態(tài)下研究的形式。CLARITY提供的是一種不需分解組織的方式。這個過程有點類似于石化或化石化,但關(guān)鍵的是基本結(jié)構(gòu)、形狀甚至是突觸水平的精細結(jié)構(gòu)多保持在原位。"
與機械切片方法不同,CLARITY可保留結(jié)構(gòu)的連續(xù)性,可跟蹤遠處的神經(jīng)突起,對追蹤到的神經(jīng)元提供3D和局部形態(tài)學信息。聯(lián)合CLARITY和光學顯微鏡可以觀察和追蹤全腦組織中熒光標記的神經(jīng)元和突起,然后通過電子顯微鏡探測和確定連接模式。
斯坦福團隊將這項技術(shù)應(yīng)用于小鼠全腦,能夠觀察從皮質(zhì)外層到深層結(jié)構(gòu)例如丘腦的神經(jīng)元。他們可以追蹤神經(jīng)元和神經(jīng)回路,觀察蛋白復(fù)合物、核酸和神經(jīng)遞質(zhì)之間的關(guān)系。
該小組還將該技術(shù)用于人類大腦標本,可看見并識別一個較大區(qū)域的神經(jīng)元和突起。研究者稱,"一個自閉癥患者0.5mm厚的額葉組織塊,存儲在福爾馬林中> 6年,我們能夠采用神經(jīng)絲蛋白和髓鞘堿性蛋白對神經(jīng)元進行染色,并追蹤單個神經(jīng)纖維。"
Deisseroth博士說,CLARITY已經(jīng)超越了科學家處理所生成數(shù)據(jù)的能力。他說,"將海量數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)化為有用信息是一個巨大的計算挑戰(zhàn),這是我們必須解決的。我們必須建立改良的計算方法以實現(xiàn)圖像分割、3-D圖像配準、自動跟蹤和圖像采集。"
CLARITY除了用于大腦,在其它領(lǐng)域還大有用武之地,它可以適用于任何生物系統(tǒng)。Deisseroth博士說,"研究癌癥的人員已經(jīng)與我們?nèi)〉昧寺?lián)系,想要將CLARITY技術(shù)用于活檢樣本,以了解人類癌癥不同階段細胞的確切體積或3D排布。這就是CLARITY自然應(yīng)用的一個例子。"此外,研究其他組織如肺、肌肉或心臟正?;虍惓9δ芎蜕韺W,成熟組織發(fā)育和功能以及組織修復(fù)的學者已經(jīng)開始使用CLARITY技術(shù)。Deisseroth博士補充說,"讓我們拭目以待CLARITY技術(shù)在其它生物學分支中的應(yīng)用,這將是很有趣的。"
編譯自:See-Through Brain a Boon to Brain Mapping Initiative.medscape.May 23, 2013
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