全基因組測序發(fā)現(xiàn)肝癌基因突變
肝細(xì)胞癌是目前最常見的一種肝癌，約占原發(fā)性肝癌的90%,我國更是該病的高發(fā)區(qū)之一。癌變本質(zhì)上講是由體細(xì)胞隨機積累起來的一些關(guān)鍵性基因組、轉(zhuǎn)錄組以及表觀遺傳變異所造成的。盡管當(dāng)前已有眾多肝細(xì)胞癌相關(guān)的研究，但由于技術(shù)和樣本量的限制，依然沒有發(fā)現(xiàn)明確具有普遍意義的基因突變。
由亞洲癌癥研究組織、中國深圳華大基因研究院等多家單位合作完成的與肝細(xì)胞癌相關(guān)的基因突變研究成果近日在《基因組研究》上發(fā)表。該研究為肝癌的分子診斷、治療及靶向藥物開發(fā)等奠定了重要的遺傳學(xué)基礎(chǔ)。
科研人員分別對88例肝細(xì)胞癌患者（其中81例HBV陽性和7例HBV陰性）的腫瘤組織和癌旁組織進行了全基因組測序。他們通過對全基因組范圍內(nèi)的單堿基變異（SNV）、拷貝數(shù)變異（CNV）、插入缺失（Indel）、結(jié)構(gòu)變異（SV）以及HBV整合位點進行檢測，發(fā)現(xiàn)了一系列與HBV介導(dǎo)的肝細(xì)胞癌發(fā)生、發(fā)展相關(guān)的基因突變及相關(guān)信號通路變化。他們將這些突變與臨床癥狀相聯(lián)系并進行了全面分析，為肝細(xì)胞癌的診斷、治療提供了新思路。
此外，科研人員還對肝細(xì)胞癌的3種亞型進行了分子突變層面的歸類，同時，該研究還鑒定出一系列與肝細(xì)胞癌發(fā)生相關(guān)的基因，其中β-catenin基因是最易發(fā)生突變的致癌基因，TP53基因是最易發(fā)生的抑癌基因。
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