圖為擬定的遺傳性反復(fù)發(fā)熱基因診斷報告模版。該圖以隱匿性疾病為例,顯示了最低限度的報告項目。理想報告應(yīng)加亮標(biāo)出主要結(jié)果且不超過1頁。HGVS:人類基因組變異學(xué)會
遺傳性反復(fù)發(fā)熱(HRF)是以發(fā)熱反復(fù)發(fā)作和漿膜炎為特征的一組單基因自身炎癥性疾病,這種疾病由參與重要自然免疫的調(diào)節(jié)基因發(fā)生致病性突變引起。分子缺陷在這些疾病中的作用一經(jīng)發(fā)現(xiàn),使得世界很多國家,包括中東、歐洲、美國、日本和澳大利亞開展基因診斷研究。然而,多種檢測方法和臨床報告都在使用,這確實需要制定HRF基因檢測的一個指南共識。
基于先前HRF外部質(zhì)量保證方案推出的現(xiàn)行實踐和文獻(xiàn)資料,編制了一份指南草案。這份草案文件經(jīng)歐洲分子遺傳質(zhì)量協(xié)作網(wǎng)發(fā)布傳播,廣泛征求意見并修訂。2011年9月18-19日,在布魯日(比利時)召開的研討會上通過了這份草案,并獲得最終共識文件;同時,針對HRF基因診斷測試提出了一套商定的最佳醫(yī)療準(zhǔn)則,目的是報告遺傳結(jié)果和確定它們的臨床意義。該論文發(fā)表在《風(fēng)濕病年鑒》 [2012,71(10):
遺傳結(jié)果
1) 應(yīng)當(dāng)描述突變的蛋白水平和核苷酸水平,以及突變應(yīng)符合最終版HGVS命名法(http://www.hgvs.org/mutnomen/)。
2) 無論何時,序列突變名稱因起始密碼子重編號碼而發(fā)生改變,都應(yīng)該報告標(biāo)準(zhǔn)命名和HGSV命名,以允許咨詢的臨床醫(yī)師找到相關(guān)資料。例如,TNFRSF1A 蛋白編碼p.Arg121Gln (NM_001065.3:c.362G→A,通用名 R92Q) ;NLRP3蛋白編碼p.Val198Met (NM_001243133.1:c.592G→A,也稱為V200M)
3) 應(yīng)當(dāng)提供使用參照序列的編號
4) 應(yīng)當(dāng)提供一份測試技術(shù)的簡述,以及這種技術(shù)對于篩查的特定人群(例如,突變篩查程度和疾病相關(guān)突變的范圍,檢測的區(qū)域和限制)的臨床和分析敏感性。
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