您所在的位置:首頁 > 腫瘤科醫(yī)學進展 > 癌癥個體化治療前景面臨考驗
日前,一項刊登在《自然》(Nature)雜志上的最新研究讓癌癥個體化療法變得復(fù)雜,研究人員發(fā)現(xiàn)了這種藥物篩查方法中存在的缺陷。癌癥個體化療法是一種根據(jù)癌癥患者的獨特遺傳學,采用特異和最佳治療方案對患者進行治療的方法。
達納-法伯癌癥研究所(Dana-Farber Cancer Institute)John Quackenbush 領(lǐng)導(dǎo)的一支研究小組將 2012 年發(fā)表在《Nature》雜志上的兩項研究的數(shù)據(jù)進行了比較,這兩項研究針對一些藥物是否能夠有效地對抗培養(yǎng)的不同癌細胞系進行了測試,總共檢測了 15 種藥物和 471 個細胞系。此外,這兩項研究還分析了這些細胞的遺傳特征,例如它們的 DNA 突變以及基因表達等。
這兩項研究發(fā)表時,被譽為是新興的腫瘤靶向醫(yī)學領(lǐng)域中重要的一步。這一領(lǐng)域的目標是找到一些能夠針對腫瘤精確的遺傳特征發(fā)起攻擊的藥物。在過去的幾年里該領(lǐng)域迅猛發(fā)展,一些藥物公司已經(jīng)開發(fā)出了針對這些遺傳特征的藥物。例如,F(xiàn)DA 在 2011 年批準了 vemurafenib,這種藥物可以攻擊具有一種特異的 BRAF 基因突變的細胞,在某些類型的皮膚癌中 BRAF 經(jīng)常異常地活化。
然而在這項最新研究中,Quackenbush 表示,來自這些初期研究的數(shù)據(jù)或許并沒有科學家們期望的那樣有用,因為這些研究給出的答案相互矛盾。
Quackenbush 指出,這是一個廣泛的警示故事。針對如何定義表型,例如患者是否可能對一種藥物產(chǎn)生反應(yīng)或是會發(fā)生不良事件,科學家必須抱謹慎的態(tài)度來推動個體化治療。
此前這兩項研究利用了不同的方法來確定一種癌細胞系是否對一種特殊藥物敏感。研究人員采用了幾種方法分析了這些結(jié)果,發(fā)現(xiàn)兩項研究中的 15 種藥物只有 2 或 3 個效應(yīng)相似。在某些情況下,一個研究將一種細胞系列為對一種藥物敏感,而另一項研究卻給出了相反的結(jié)論。
遺傳一致
兩項研究的作者并不認為這些結(jié)果相互矛盾。其中一篇《Nature》文章的共同領(lǐng)導(dǎo)者、Dana-Farber 癌癥研究所癌癥遺傳學家 Levi Garraway 說:“根本就還不能確定數(shù)據(jù)不一致。”他認為,兩篇論文都正確地報道了,對某些藥物具有已知遺傳弱點的細胞確實對這些藥物敏感——例如,他們都確定具有 BRAF 突變的細胞系對于 BRAF 蛋白抑制劑以及它的激活蛋白 MEK 抑制劑敏感。對于 Garraway 而言,這表明了兩種篩查方法都能夠找到有用的藥物靶點。
盡管如此,Quackenbush 的分析還是引發(fā)了關(guān)于癌癥藥物開發(fā)和個體化醫(yī)學研究人員應(yīng)該如何處理大規(guī)模藥物篩查數(shù)據(jù)的討論。
Tetralogic 制藥公司首席科學家 Glenn Begley 提出要注意藥物研發(fā)中的重現(xiàn)性問題,他表示:“這篇論文提供了一個重要的教訓(xùn)。如果你打算要用這些結(jié)果來支持藥物研發(fā)計劃,你必須確定它們是可靠的,這個例子表明了不同的數(shù)據(jù)集之間存在驚人的不一致”
標準問題
加拿大多倫多 Margaret 公主癌癥中心主任醫(yī)生 Lillian Siu,一直以來都是基于細胞系篩查研究一類的數(shù)據(jù)來開展癌癥藥物研究。Lillian 表示:“它讓人們意識到,當我們讀取這些臨床前數(shù)據(jù)時,我們應(yīng)該更加意識到存在不一致的地方,有可能會導(dǎo)致不同的結(jié)論。”
Quackenbush 和同事們說,還需要不同的研究小組共同合作,為通過大規(guī)模細胞系篩查來檢測藥物效力的實驗制定出一些標準。他的研究小組發(fā)現(xiàn)來自兩項研究的遺傳數(shù)據(jù)大部分一致,例如均找到了相似的基因表達數(shù)據(jù),證實在過去十年里人們針對設(shè)立遺傳數(shù)據(jù)收集標準所付出的努力,提高了這些數(shù)據(jù)的可靠性。
Quackenbush 分析的第二篇《Nature》論文的共同領(lǐng)導(dǎo)者、麻省總醫(yī)院 Cyril Benes 說,他和 Garraway 的研究都討論了如何讓他們的研究小組收集的數(shù)據(jù)更好地為其他研究人員所用。但他表示:“這是極大和極復(fù)雜的工作,我認為我們無法承擔擱置所有這些研究項目,而去重新思考方法和標準所付出的代價。”
此外,MD 安德森癌癥中心的系統(tǒng)生物學教授 Gordon Mills 認為,為大規(guī)模藥物篩查研究制定標準遠比聽起來更為復(fù)雜,因為尚不明確哪些分析能夠最好地預(yù)測哪些藥物能夠在人體起作用。他說:“這篇論文描述了一個重要的問題,然而在目前情況下沒有顯而易見的解決辦法。”
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