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    隨著埃博拉病毒橫掃西非，科學(xué)家缺乏重要基因數(shù)據(jù)來解答引發(fā)眾多擔(dān)憂的猜測：這種病毒會(huì)變得更具傳染性和更致命嗎？它會(huì)發(fā)生變化，讓其逃避診斷測試或疫苗嗎？非洲和歐洲實(shí)驗(yàn)室的冰箱里存放著取自埃博拉患者的數(shù)千份血液樣本，但它們并未被使用，且少數(shù)幾個(gè)獲得新基因數(shù)據(jù)的研究小組并未**息。
 

    研究人員渴望近距離觀察病毒可能是如何進(jìn)化的。英國愛丁堡大學(xué)研究傳染病的進(jìn)化生物學(xué)家Andrew Rambaut表示，除了要回答有關(guān)其毒性的問題外，基因數(shù)據(jù)還能揭示疾病流行的細(xì)節(jié)，包括傳播特點(diǎn)以及病毒從動(dòng)物宿主傳播到人類需要多久。“如果可以及時(shí)完成檢測，就可以確切了解到發(fā)生了什么。”他說。但面對(duì)官僚障礙和記錄混亂等問題，科學(xué)家不得不等待。

    今年8月，研究人員公布了塞拉利昂78位患者感染的埃博拉病毒的99個(gè)基因組，讓全世界能夠近距離看到埃博拉病毒分子。該分析包含了當(dāng)時(shí)塞拉利昂已知的一半多病例。

    研究結(jié)果一經(jīng)確定，科學(xué)家就將基因數(shù)據(jù)放置在了公共數(shù)據(jù)庫中。這些數(shù)據(jù)揭示了在塞拉利昂疫情初期，病毒在人際傳播時(shí)是如何變化的，在之后的病例中，一種變體消失，而另一種則凸顯出來。自那時(shí)起，這次疾病轉(zhuǎn)變成了傳染性疾病，但美國羅德研究所的Pardis Sabeti和Stephen Gire領(lǐng)銜的該研究小組卻沒能從塞拉利昂獲得任何新樣本。其他研究小組也遇到了類似困境。

    數(shù)位研究人員均表示，從當(dāng)?shù)厣硐堇Ь车慕】挡块T獲得樣本輸出許可十分困難。“我只能假設(shè)當(dāng)?shù)氐南嚓P(guān)系統(tǒng)不堪重負(fù)，制備樣本不是其優(yōu)先項(xiàng)目。”Rambaut說。他也是8月份發(fā)表的論文的合作者。

    德國Bernhard Nocht熱帶醫(yī)學(xué)研究所（BNI）病毒學(xué)家、歐洲移動(dòng)實(shí)驗(yàn)室（EMLab）聯(lián)盟協(xié)調(diào)人Stephan Günther表示，他們無法從尼日利亞和利比里亞輸出樣本。但他表示，BNI從3月開始一直在接收EMLab項(xiàng)目的幾內(nèi)亞樣本，目前已經(jīng)接近3000個(gè)。BNI代表幾內(nèi)亞**將這些樣本儲(chǔ)存在高安全級(jí)別辦公室里，幾內(nèi)亞**仍是這些樣本的所有者。

    Günther和同事還未對(duì)這些樣本進(jìn)行測序，原因是聯(lián)盟的同事正忙于支援被感染國家的疾病監(jiān)測中心。“我們?nèi)棵τ诂F(xiàn)場工作。”Günther說，“人員是很大問題。”但他指出，歐盟新?lián)芰?70萬歐元給EMLab進(jìn)行埃博拉研究，問題或能得到緩解。

    在法國，巴斯德研究所也經(jīng)歷了西非樣本輸入的困境，但他們?nèi)杂?jì)劃迅速測序新病毒基因。巴斯德研究所埃博拉特別小組協(xié)調(diào)人Felix Rey表示，該研究所位于達(dá)喀爾（塞內(nèi)加爾首都）的實(shí)驗(yàn)室最近收到來自幾內(nèi)亞的樣本。達(dá)喀爾實(shí)驗(yàn)室將提取RNA,并送到巴黎進(jìn)行高通量測序。“我們希望下個(gè)月能利用一二百個(gè)樣本測序該病毒。”Rey說。

    另外，與Sabeti合作的杜蘭大學(xué)Robert Garry 表示，Sabeti和同事也可能很快獲得塞拉利昂樣本。但為了加速研究，她和同事正試著弄到經(jīng)費(fèi)，將測序機(jī)器運(yùn)到西非。“如果我們不能在這里（美國）得到樣本，那么我們將在那里進(jìn)行測序。”她說。

    但僅靠血液樣本不足以進(jìn)行基因組學(xué)研究。研究人員還至少需要知道每位患者來自哪里，理論上還需要患者存活或死亡等臨床信息。“只有當(dāng)獲得這些數(shù)據(jù)后，你才能找到對(duì)測序有用的信息。”Günther說。但由于記錄質(zhì)量不一，這些信息通常已經(jīng)丟失。他和同事目前正與無國界醫(yī)生組織和世界衛(wèi)生組織進(jìn)行合作，以便將樣本和相關(guān)信息進(jìn)行匹配，但他表示，建設(shè)數(shù)據(jù)庫是一項(xiàng)耗時(shí)耗力的工作。

    同時(shí)，最初一批塞拉利昂樣本產(chǎn)生的若干病毒序列結(jié)果并沒有公布。美國疾控中心（CDC）在8月宣布測序了取自在該國接受治療的患者的樣本，但數(shù)據(jù)并沒有被放入任何公共基因庫中。Rambaut表示，這令人十分遺憾。“美國的病例來自利比里亞，迄今為止我們沒有任何基因序列信息來自那里，即使一個(gè)基因組也十分有用。”他說。但CDC生物信息學(xué)家Duncan MacCannell在接受《科學(xué)》雜志采訪時(shí)表示，這些序列已經(jīng)“與公共健康界積極共享和討論過了”.他表示，CDC正著手將序列信息提交給公共數(shù)據(jù)庫。

    Rambaut表示，新序列可能不會(huì)顯示該病毒正在出現(xiàn)新的攻擊或傳播方式，但有助于得出更清晰的疫情暴發(fā)圖。他還指出，一連串類似病毒可能指向一個(gè)傳播熱點(diǎn)區(qū)域，同時(shí)異常高的多樣性表明尚有許多病例未被發(fā)現(xiàn)。

    “更早的基因數(shù)據(jù)還表明，埃博拉病毒正經(jīng)歷快速變化，但這并不一定表明它正變得越來越危險(xiǎn)。”Rambaut說，“大部分RNA病毒突變速度都很迅速，但適應(yīng)性和功能性改變卻是很慢的過程。”麻疹病毒變異的速度與埃博拉病毒類似，但卻尚未成功脫離一次患病、終身免疫或用疫苗進(jìn)行控制。雖然疫情十分嚴(yán)重，但Rambaut說，“沒有理由懷疑，埃博拉病毒會(huì)迅速改變生命周期或傳播模式”.