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利用基因組序列設(shè)計(jì)候選藥物的突破性新方法

2014-02-12 09:49 閱讀:2232 來(lái)源:生物360 作者:孫福慶 責(zé)任編輯:云霄飄逸
[導(dǎo)讀] 日前,來(lái)自斯克里普斯研究所的科學(xué)家開(kāi)發(fā)出了一種很有潛力的通用方法,可通過(guò)基因組序列來(lái)設(shè)計(jì)新藥,并利用這種方法識(shí)別出一種高效化合物,其能讓癌細(xì)胞攻擊自身并最終死亡。

   

    日前,來(lái)自斯克里普斯研究所的科學(xué)家開(kāi)發(fā)出了一種很有潛力的通用方法,可通過(guò)基因組序列來(lái)設(shè)計(jì)新藥,并利用這種方法識(shí)別出一種高效化合物,其能讓癌細(xì)胞攻擊自身并最終死亡。

    論文主要作者、斯克里普斯研究所副教授MatthewDisney表示:“這還是第一次只憑借一個(gè)RNA序列,就理性地設(shè)計(jì)出治療性小分子。許多人可能懷疑這一點(diǎn)。我們證明了這種方法能以前所未有的精確性瞄準(zhǔn)一個(gè)致癌RNA.”

    Disney的實(shí)驗(yàn)室一直在開(kāi)發(fā)能掌控藥物與RNA折疊結(jié)合的方法,尤其是對(duì)microRNA(微RNA)的控制。微RNA上世紀(jì)90年代才被發(fā)現(xiàn),是一種存在于所有動(dòng)植物細(xì)胞中的短分子。通常,每個(gè)微RNA作為一個(gè)或多個(gè)基因的“光控開(kāi)關(guān)”,與這些基因的轉(zhuǎn)錄結(jié)合并有效防止它們轉(zhuǎn)錄成蛋白質(zhì)。以這種方式,微RNA調(diào)節(jié)著各種各樣的細(xì)胞過(guò)程。有些微RNA與疾病相關(guān),比如MiR-96,能阻礙凋亡過(guò)程或編程細(xì)胞的死亡,使細(xì)胞生長(zhǎng)失控而促發(fā)癌癥。

    研究人員將他們的方法稱為信息RNA.這是一種計(jì)算技術(shù),通過(guò)計(jì)算能找到針對(duì)疾病相關(guān)基因組序列的信息,以及所有瞄準(zhǔn)該序列的細(xì)胞RNA,再通過(guò)細(xì)胞RNA找到針對(duì)性藥物。這些藥物RNA序列能針對(duì)性地與數(shù)以千計(jì)的細(xì)胞RNA序列相互左右,而對(duì)其他序列沒(méi)有影響。

    利用信息RNA,他們識(shí)別出了瞄準(zhǔn)MiR-96的化合物,以及瞄準(zhǔn)其他20多種疾病相關(guān)微RNA的化合物。研究顯示,抑制MiR-96的候選藥物能抑制癌細(xì)胞生長(zhǎng),而且那些沒(méi)有功能性MiR-96的細(xì)胞不會(huì)受到藥物影響。

    Disney指出:“這說(shuō)明該方法在藥物選擇方面具有前所未有的精確性。此外,新的候選藥很容易生產(chǎn),具有細(xì)胞滲透性,能專門瞄準(zhǔn)MiR-96,針對(duì)性遠(yuǎn)遠(yuǎn)超過(guò)目前最先進(jìn)的RNA瞄準(zhǔn)技術(shù)。”

    論文第一作者、Disney實(shí)驗(yàn)室的研究生SaiPradeepVelagapudi表示:“利用我們的程序,能找到高度特化的藥物。我們希望將來(lái)能針對(duì)其他癌癥或任何疾病RNA設(shè)計(jì)出候選藥物。”


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