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    最近，新加坡A*STAR基因組研究所（GIS）的科學(xué)家開發(fā)出一種新技術(shù)，簡(jiǎn)化了準(zhǔn)確識(shí)別致病DNA突變的任務(wù)，為新藥開發(fā)和新的疾病診斷法奠定了基礎(chǔ)。
 

    設(shè)計(jì)新的藥物治療糖尿病、類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎這樣的疾病，通常是非常困難的，因?yàn)槲覀儾恢浪幬飸?yīng)該靶定體內(nèi)哪些分子。如果我們能夠找出導(dǎo)致特定疾病的基因突變，我們就可以將這些突變與特定蛋白質(zhì)聯(lián)系起來，然后設(shè)計(jì)藥物來阻斷或激活這些蛋白。我們還可以測(cè)量以這種方式確定的蛋白質(zhì)的活性，更準(zhǔn)確地診斷疾病，這是精密醫(yī)學(xué)的一個(gè)主要目標(biāo)。延伸閱讀：DNA轉(zhuǎn)錄和致病擴(kuò)增之間的聯(lián)系。

    GIS綜合基因組學(xué)副主任Shyam Prabhakar帶博士領(lǐng)的一個(gè)科學(xué)家團(tuán)隊(duì)，開發(fā)了一種新的遺傳分析技術(shù)，稱為Genotype-independent Signal Correlation and Imbalance （G-SCI）試驗(yàn)，可檢測(cè)基因組中特定的化學(xué)變化，并將它們連接到附近的基因突變。然后他們發(fā)現(xiàn)，與這些化學(xué)變化相關(guān)的基因突變也可能導(dǎo)致疾病。G-SCI測(cè)試在一項(xiàng)包含57個(gè)人的研究中得到了驗(yàn)證，相關(guān)研究結(jié)果發(fā)表在最近的《自然方法》（Nature Methods）。

    當(dāng)在這項(xiàng)研究中與化學(xué)分析方法結(jié)合使用時(shí)，在識(shí)別有害基因突變方面，G-SCI試驗(yàn)比現(xiàn)有的方法敏感10倍。該研究的共同第一作者、GIS的Ricardo del Rosario說：“G-SCI測(cè)試是變革的——不是檢測(cè)500個(gè)人的基因表達(dá)相關(guān)性，而是進(jìn)行僅僅50至60的組蛋白乙?；治?。這減少了每項(xiàng)研究需要的受試者數(shù)量，并使得我們能夠深入調(diào)查疾病。”

    本研究另外共同第一作者、GIS 的Jeremie Poschmann博士，強(qiáng)調(diào)新方法的另一個(gè)好處：“我們不是使用基因組測(cè)序，而是利用來自于我們方法檢測(cè)DNA突變的組蛋白乙?；瘻y(cè)序數(shù)據(jù)。這為我們節(jié)省了大量的時(shí)間、精力和資源。”

    加州大學(xué)圣地亞哥分校（UCSD）細(xì)胞與分子醫(yī)學(xué)系、Ludwig癌癥研究所的任兵教授評(píng)價(jià)說：“這是一項(xiàng)令人興奮的研究，為基因調(diào)控的遺傳分析設(shè)立了一種新的基準(zhǔn)。該方法大大提高了我們理解人類基因組的能力，并將有利于疾病遺傳基礎(chǔ)的研究。”

    科學(xué)家們驗(yàn)證了新測(cè)試的有效性，并能夠識(shí)別與某些遺傳疾病的聯(lián)系。Prabhakar博士說：“我們發(fā)現(xiàn)，擾動(dòng)基因組化學(xué)狀態(tài)的突變，與引起自身免疫性疾病的突變之間有著強(qiáng)烈關(guān)聯(lián)。這時(shí)我們知道，我們用G-SCI測(cè)試方法命中了靶心。”

    斯坦福大學(xué)的Jonathan Pritchard 教授評(píng)論說：“這項(xiàng)工作，為將遺傳變異與染色質(zhì)功能變異相關(guān)聯(lián)，提供了重要的新工具，并提供了令人信服的證據(jù)表明，這類遺傳變異在人類疾病中起著核心作用。”

    GIS執(zhí)行董事Huck-Hui Ng 教授表示：“我很高興，這一新方法具有卓越的精度用于鑒定致病突變。G-SCI方法創(chuàng)新性地利用遺傳信息，來選擇人類基因組區(qū)域用于疾病關(guān)聯(lián)分析。隨著我們看到越來越大和越來越復(fù)雜的數(shù)據(jù)集，業(yè)界將面臨即將到來的大數(shù)據(jù)分析挑戰(zhàn)。該方法擴(kuò)展了新加坡基因組研究所的計(jì)算分析能力。”