危險(xiǎn),既可以指危及人身安全,即有毒物品,也可以指導(dǎo)致實(shí)驗(yàn)失敗的因素。本文所說(shuō)的危險(xiǎn),指的是第二種含義。
很多因素都可以影響實(shí)驗(yàn)的成敗,一個(gè)小小的失誤,可能就會(huì)毀掉一個(gè)實(shí)驗(yàn)。而有些因素,卻可能導(dǎo)致很多實(shí)驗(yàn)都失敗。這樣的因素,便是我所認(rèn)為的“實(shí)驗(yàn)室里最危險(xiǎn)的東西”.
1. 空氣
我們不是在真空里面做實(shí)驗(yàn),即使大部分時(shí)候試劑是蓋上的,但是總有接觸空氣的時(shí)候。如果空氣質(zhì)量不好,例如灰塵含量過(guò)高,細(xì)菌、真菌含量太多,就非常容易污染試劑,導(dǎo)致實(shí)驗(yàn)失敗。
所以,最好定期檢測(cè)空氣的質(zhì)量。可以用不加氨芐西林的LB培養(yǎng)皿暴露于空氣中一小時(shí),然后37度孵育一天,看有多少細(xì)菌克隆來(lái)檢測(cè)細(xì)菌含量(這個(gè)我沒(méi)做過(guò)),用加氨芐西林的LB培養(yǎng)皿暴露于空氣中一小時(shí),室溫下避光孵育3天,看有多少真菌克隆來(lái)檢測(cè)真菌含量。如果細(xì)菌和真菌很多,一定要非常注意無(wú)菌技術(shù)。
我曾經(jīng)用LB培養(yǎng)皿檢測(cè)過(guò)空氣中的真菌,結(jié)果見(jiàn)下圖。但是,專門用于培養(yǎng)真菌的Sabouraud Agar plate http://www.microbelibrary.org/component/resource/laboratory-test/3156-sabouraud-agar-for-fungal-growth-protocols 應(yīng)該效果更好。
這是我在做大腸桿菌培養(yǎng)的時(shí)候發(fā)現(xiàn)有真菌污染之后做的空氣中真菌含量檢測(cè)。左側(cè)是放在試驗(yàn)臺(tái)上一個(gè)小時(shí),右側(cè)是放在室外一個(gè)小時(shí)??梢?jiàn),室內(nèi)空氣中有真菌,但是比室外要少。
為了保持實(shí)驗(yàn)室內(nèi)的空氣質(zhì)量,應(yīng)該定期打掃實(shí)驗(yàn)室,因?yàn)榈匕?、?shí)驗(yàn)臺(tái)上的灰塵在走動(dòng)時(shí)會(huì)揚(yáng)起,角落里的垃圾可能是細(xì)菌和真菌的良好培養(yǎng)基。同時(shí),一般來(lái)說(shuō)實(shí)驗(yàn)室外面的空氣中細(xì)菌真菌含量高于實(shí)驗(yàn)室內(nèi),所以最好不要開(kāi)窗。
2. 水
幾乎所有的試劑都是在溶液中起反應(yīng),所以做實(shí)驗(yàn)的時(shí)候,一定要保證水的質(zhì)量合格。如果水的質(zhì)量不達(dá)標(biāo),實(shí)驗(yàn)失敗在所難免。我就在網(wǎng)上看到有人說(shuō)當(dāng)他們用Milli –Q water去清洗玻片的時(shí)候,組織從玻片上掉下來(lái),而換用普通的水之后,問(wèn)題就消失了, 見(jiàn)http://www.ihcworld.com/smf/index.php?topic=2401.0 (當(dāng)然,這個(gè)不一定完全可靠,因?yàn)闆](méi)有做嚴(yán)格的對(duì)照和重復(fù))。在《At the Bench》一書(shū)里,作者寫道:很多人都知道,有些實(shí)驗(yàn)僅僅是因?yàn)閾Q了一種配溶液的水就做不出來(lái)了。
在我們這里,如果系統(tǒng)沒(méi)有問(wèn)題的話,Milli-Q 水可以滿足絕大部分實(shí)驗(yàn)的要求。對(duì)于用水純度要求高的實(shí)驗(yàn),例如原位雜交,最好用公司購(gòu)買的配好的溶液。如果實(shí)驗(yàn)出現(xiàn)問(wèn)題懷疑是水的質(zhì)量所致,可以用公司購(gòu)買的水作為對(duì)照檢驗(yàn)其質(zhì)量。
3. Pipette(移液器)
幾乎所有操作都要用到移液器,如果移液器污染,則可能導(dǎo)致實(shí)驗(yàn)失敗。所以,要保持移液器清潔,移液的時(shí)候,要防止液體進(jìn)入移液器。有些實(shí)驗(yàn)例如RNA操作,最好用filter tip 以防止移液器里的RNase或者微生物進(jìn)入樣品。
去除移液器表面的RNase的方法:我從網(wǎng)上看到的方法是用10%的bleach清洗。但是導(dǎo)師說(shuō)bleach會(huì)破壞移液器的塑料,所以他建議我先用普通的清潔劑清洗,然后用70%的酒精清洗。不知道有沒(méi)有更好的方法?
4. EP管和槍頭
很多反應(yīng)是在EP管中進(jìn)行的,很多試劑分裝于EP管中,絕大部分的移液都要用到槍頭。如果EP管和槍頭被污染,自然會(huì)對(duì)實(shí)驗(yàn)有影響。我所用過(guò)的EP管和槍頭都沒(méi)有遇到過(guò)問(wèn)題,但是我記得曾經(jīng)看過(guò)一篇SCIENCE的報(bào)道說(shuō)一次性塑料實(shí)驗(yàn)用品會(huì)釋放出微量的物質(zhì)。作者在用單胺氧化酶B做試驗(yàn)的時(shí)候,發(fā)現(xiàn)酶的活性被抑制,于是檢測(cè)了不同品牌的tube和tip,果然發(fā)現(xiàn)了能夠抑制該酶活性的物質(zhì):di(2-hydroxyethyl)methyldodecylammonium,9-octadecenamide.他們檢測(cè)的品牌包括著名的Fisher Scientific(1)。
絕大部分的EP管和槍頭都注明是“DNase and RNase Free”,但是,專門生產(chǎn)RNase抑制劑的Ambion公司卻說(shuō)不一樣是RNase free.所以,最近我在做原位雜交的實(shí)驗(yàn)時(shí),就檢測(cè)了EP管的RNase.一管用***清洗,一管不清洗,然后加入RNA,37度孵育一小時(shí),電泳,結(jié)果沒(méi)有區(qū)別。當(dāng)然,我孵育的時(shí)間不是很長(zhǎng),樣本量不大,也沒(méi)有重復(fù)。
一般來(lái)說(shuō),EP管和槍頭不會(huì)對(duì)實(shí)驗(yàn)有太大的影響,尤其是來(lái)自于知名品牌的產(chǎn)品。如果是非知名品牌,或者需要做非常敏感的實(shí)驗(yàn),還是有必要檢測(cè)的。
5. 過(guò)期的試劑
過(guò)期失效的試劑導(dǎo)致實(shí)驗(yàn)失敗是再正常不過(guò)的了。所以,一般情況下不要使用過(guò)期的試劑,尤其不能使用別人的留下的過(guò)期試劑(我曾經(jīng)有過(guò)血的教訓(xùn))。有些試劑,例如抗體、酶,是容易變質(zhì)的,但是,一般情況下過(guò)了產(chǎn)品說(shuō)明書(shū)所說(shuō)的保質(zhì)期還可以用。因?yàn)檫@些試劑比較貴,所以一般過(guò)了保質(zhì)期還會(huì)繼續(xù)使用。使用這樣的試劑,如果不清楚是否依然有效,就要設(shè)立對(duì)照來(lái)檢驗(yàn)。例如,對(duì)于限制性內(nèi)切酶,可以用已知不耐受酶切的質(zhì)粒+沒(méi)有問(wèn)題的buffer作為一個(gè)對(duì)照,檢驗(yàn)酶的活性。
最安全的地方就是最危險(xiǎn)的地方,最不容易想到的導(dǎo)致實(shí)驗(yàn)失敗的因素就是實(shí)驗(yàn)室里最危險(xiǎn)的東西。以上所說(shuō)的情況,一般都不會(huì)有問(wèn)題,但是如果實(shí)驗(yàn)失敗,檢測(cè)了很多因素還是找不到原因,可能就需要懷疑這幾個(gè)因素了。
參考文獻(xiàn):
1. G. R. McDonald et al., Science 322, 917 (Nov, 2008)。
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