近年來,利用無創(chuàng)產(chǎn)前檢測(NIPT)來篩查胎兒的染色體非整倍體已廣泛應(yīng)用,并有望從高危孕婦擴展到一般風險的孕婦。4月1日在線發(fā)表于《新英格蘭醫(yī)學雜志》上的三項新的研究,闡明了NIPT篩查的表現(xiàn)和風險。
文獻來源:Accurate Desc**tion of DNA-Based Noninvasive Prenatal Screening.
Copy-Number Variation and False Positive Prenatal Aneuploidy Screening Results.
Cell-free DNA Analysis for Noninvasive Examination of Trisomy.
根據(jù)貝勒醫(yī)學院和香港中文大學的一項研究,NIPT假陽性結(jié)果的風險相當可觀,如果孕婦不進行診斷確認,很可能導(dǎo)致不可逆轉(zhuǎn)的妊娠終止。研究人員警告說,盡管新檢測有著高的敏感性和特異性,但只能用于篩查,而不能替代確認性的染色體核型分析。
另一項由華盛頓大學團隊領(lǐng)導(dǎo)的研究,深入分析了NIPT可能產(chǎn)生假陽性結(jié)果的原因之一,那就是母親基因組中存在拷貝數(shù)變異。
盡管它有這些缺點,但根據(jù)一項大型臨床研究的結(jié)果,NIPT在21三體的檢測上還是優(yōu)于傳統(tǒng)的孕早期檢測。這項研究由加州大學舊金山分校領(lǐng)導(dǎo),涉及到16,000名女性。
為了研究各種無創(chuàng)產(chǎn)前檢測的表現(xiàn),貝勒和香港的研究人員重點研究了307名婦女,她們獲得了陽性的NIPT結(jié)果,包括21三體、18三體、13三體、X單體、XXX、XXY或XYY,并轉(zhuǎn)診到侵入性的診斷檢測。這些結(jié)果來自Sequenom的MaterniT21和SafeT21,BGI的NIFTY、Illumina的Verifi、Natera的Panorama以及Ariosa的Harmony.
對于13個病例,羊膜穿刺或絨毛膜取樣后的核型分析表明嵌合的存在。而對于剩下294個NIPT陽性病例,19%(56個)被證明是假陽性的。其中,對于最常檢測到的21三體,假陽性率在9%,XXX、XXY或XYY為17%,18三體為23%,13三體為46%,而X單體高達62%.
盡管染色體核型分析的結(jié)果也有可能是不準確的,但研究人員并沒有被告知,嬰兒在出生后有任何異常。香港中文大學的研究人員注意到,至少有8例假陽性的NIPT結(jié)果(大部分是21三體),但最終生下了健康的嬰兒。
NIPT目前都是分析母體血液中的無細胞循環(huán)DNA,但它們的分析方法不同。NIPT產(chǎn)生假陽性結(jié)果,可能有幾個原因,包括母體的體細胞嵌合、胎盤嵌合、雙胞胎消失、母親的癌癥未被檢測到,以及母親的拷貝數(shù)變異。
華盛頓大學的研究人員深入探究了最后一個原因。在這一項研究中,他們分析了四名婦女的血液樣本。這些婦女接受了Illumina的Verifi檢測,并獲得了陽性結(jié)果,其中有三名是18三體陽性,另一名是13三體陽性,但是最終誕下了健康的嬰兒。
對于兩名NIPT檢測結(jié)果為18三體陽性的患者,他們在18號染色體上鑒定出重復(fù)的區(qū)域。研究人員推測,這些重復(fù)可能干擾了分析,因為18號染色體的測序讀取比其他染色體多。
血液中大部分的無細胞DNA都來自母親,而母體的重復(fù)使得讀取數(shù)量增加,提高了假陽性的機會,而染色體缺失則減少了讀取數(shù)量,提高了假陰性結(jié)果的概率。
這個影響究竟有多大,取決于無細胞DNA中胎兒的比例,重復(fù)或缺失的大小,以及它是否遺傳給胎兒。有一名患者的18號染色體上有一段長達1.5 Mb的重復(fù),并遺傳給了胎兒,故假陽性結(jié)果的概率高了16,000倍。
基于拷貝數(shù)變異在一般人群中的頻率,研究人員估計它們明顯提高了NIPT獲得假陽性結(jié)果的風險。不過,若是考慮母體的拷貝數(shù)變異,風險可降低。例如,一旦檢測到這樣的變異,則這一區(qū)域的讀取至少應(yīng)被部分丟棄,或根據(jù)需要增加或減少染色體的有效大小。
與貝勒和香港的研究一樣,作者認為,盡管與傳統(tǒng)的孕早期篩查相比,NIPT表現(xiàn)良好,但后續(xù)的診斷檢測仍然很關(guān)鍵。“假陽性篩查結(jié)果的影響不僅僅是臨床風險和經(jīng)濟成本,還給患者帶來了巨大的心理壓力,”他們寫道。
盡管NIPT的實施仍然需要謹慎,但大型的臨床研究證明,對于高風險和低風險的妊娠,它優(yōu)于傳統(tǒng)的孕早期21三體篩查。這項研究由加州大學舊金山分校、哥倫比亞大學和Ariosa的研究人員參與,其結(jié)果已在去年的ACMG年會上展示,但現(xiàn)在才正式發(fā)表。
不過,研究人員也表示,雖然這些結(jié)果支持NIPT在各類婦女上的使用,但還需要進一步的成本效用分析。在上周舉行的ACMG年會上,Ariosa的CEO Ken Song就算了一筆賬。
在美國,每年大約有400萬名嬰兒出生。假設(shè)篩查率在70%,Song計算出,標準的孕早期篩查(FTS)將檢測出7800例21、18或13三體,而NIPT將檢測出近9000例。由于假陽性率較高,F(xiàn)TS將導(dǎo)致1400例大多不必要的侵入性檢查,而NIPT則少于100例。
Song認為,如果NIPT定價在453美元或以下,那么它將節(jié)省每個三體病例的總體成本。這個計算假定FTS為171美元,侵入性診斷檢測為1300美元,拜訪醫(yī)生需要120美元,以及妊娠終止和患病兒童出生的各種費用。
英國倫敦大學學院兒童健康研究所的Lyn Chitty認為,NIPT的采用將最終“取決于當?shù)氐奈幕蜕鐣蛩?,包括對殘疾的態(tài)度、終止妊娠的法律,以及現(xiàn)有的醫(yī)療結(jié)構(gòu)”,如現(xiàn)行的篩查項目。
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